Vladivostok Linux User Group

Хочется странного: кидать файлы в каталог (который примонтирован черезе FUSE) и чтобы они попадали в некую програмулину, которая их уже и будет обрабатывать.
Или есть аналоги FUSE, которые помогут?

Посмотри в сторону clamfs, думаю сможешь допилить до своих потребностей.